本行於1991年8月13日奉准設立，1992年1月14日取得公司執照，並於1992年2月12日正式對外營業。開業伊始，以商業銀行型態致力於提供工商企業、社會大眾優質之金融服務。2007年12月28日由二大全球金融集團SAC及GE Money參與增資。 為厚實長期市場競爭力，萬泰商業銀行於2014年2月10日通過股份轉換為中華開發金融控股公司之子公司。中華開發金控則為目前臺灣唯一以產業金融與證券為主要業務之金融控股公司，除資本厚實外，旗下主要子公司中華開發工業銀行和凱基證券，更長期在臺灣和海外投資銀行業務與資本市場居於領先地位。
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