認識我們: 本縣衛生機構自民國前七年設置至民國九十二年止，有九十七年歷史。目前依澎湖縣政府組織自治條例第八條第一項規定重新訂定本局組織規程，於八十九年一月一日起正式將課室名稱更改為醫政藥政課、食品衛生課、保健課、疾病管制課、檢驗課、企劃課、總務室、人事室、會計室、政風室等單位。 　為加強衛生局的指揮監督功能，將衛生所改隸屬衛生局。同時澎湖縣各鄉鎮也在離島設立衛生室，本縣總計設立了十四個衛生室。 　　民國七十五年因公共衛生業及醫療保健業務發展迅速，辦公廳舍及場所不敷使用，為方便民眾洽公之便，故籌劃遷址，經協調有關單位，始於七十六年三月遷入現址：馬公市中正路一一五號衛生大樓，並向上級爭取經費，重新規劃整修為辦公室，繼續加強為民服務。並殷切期望，衛生醫療保健工作能有高效率之推展，以保障縣民健康。